賽默飛 NanoDrop Eight 分光光度計是一款多通道微量紫外-可見光檢測儀器,廣泛用于高通量樣本定量,特別是在分子生物學、基因組學、蛋白質組學、臨床研究以及生物技術行業中。與傳統比色皿檢測相比,NanoDrop Eight 采用微量檢測平臺技術,僅需 1–2 μL 樣品 即可完成核酸、蛋白質、寡核苷酸以及其他生物分子的定量和純度分析。
為了確保實驗結果的準確性和可重復性,研究者必須嚴格遵循樣本制備和檢測的相關要求。本文將系統總結 NanoDrop Eight 在使用過程中對樣本的要求,包括樣本體積、濃度、純度以及不同實驗場景下的特定注意事項。
NanoDrop Eight 支持多種生物樣本的光度檢測,主要包括:
核酸樣本
DNA(基因組 DNA、質粒 DNA、PCR 產物等)
RNA(總 RNA、mRNA、tRNA 等)
寡核苷酸(合成引物、探針等)
蛋白質樣本
純化蛋白
細胞裂解液中的粗提蛋白
常見蛋白濃度測定方法包括紫外吸收法(A280)和染料結合法(Bradford、BCA 等)。
其他樣本
細胞或病毒裂解液
多肽溶液
一些特定的小分子化合物(只要在紫外-可見區有吸收峰)。
每個檢測通道只需 1–2 μL 樣品。
過量樣品可能造成浪費,而不足會導致檢測失敗。
NanoDrop Eight 的線性檢測范圍較寬,但不同樣本類型有所區別:
雙鏈 DNA:2–15,000 ng/μL
RNA:2–5,000 ng/μL
寡核苷酸:2–5,000 ng/μL
蛋白質(A280 法):0.1–100 mg/mL
蛋白質(染料法):靈敏度更高,可用于低濃度樣本
核酸檢測需通過 A260/A280 比值和 A260/A230 比值來評估純度。
A260/A280 在 1.8–2.0 之間表示核酸較純凈。
A260/A230 在 2.0–2.2 之間表示基本無有機物或鹽類殘留。
蛋白質檢測時,緩沖液中不應含有在 280 nm 處有強吸收的成分。
任何沉淀或懸浮顆粒都會影響結果,應先進行離心或過濾。
常用溶劑包括去離子水、TE 緩沖液、PBS、Tris 緩沖液等。
溶劑必須與實驗體系匹配,并作為“空白”參比。
樣本應無明顯黏稠感,過高濃度的 DNA 溶液需稀釋。
樣品應避免蛋白質、酚或鹽污染,否則 A260/A280 和 A260/A230 比值會異常。
檢測前輕輕混勻,避免部分沉淀。
RNA 樣品需避免降解,操作時應使用 RNase-free 器材。
RNA 質量可通過 A260/A280 比值初步判斷,理想值約為 2.0。
若需進一步確認完整性,應結合凝膠電泳或生物分析儀檢測。
合成的寡核苷酸需溶解均勻,避免局部沉淀。
在核酸定量中,ε(摩爾消光系數)需輸入正確,以保證計算準確。
適用于含有色氨酸、酪氨酸殘基的蛋白。
要求樣品緩沖液在 280 nm 處無強吸收背景。
高鹽或表面活性劑會干擾測定,應避免使用。
常見有 Bradford 法、BCA 法。
適用于低濃度或無芳香族氨基酸殘基的蛋白。
需要繪制標準曲線,確保定量準確。
核酸濃度過低可能導致擴增失敗,應確保 DNA 在 10 ng/μL 以上。
質粒 DNA 檢測應排除 RNA 污染。
RNA 樣品必須高純度,A260/A280 在 2.0 左右。
RNA 應避免反復凍融。
樣本緩沖液中避免含 SDS、Tris 等強吸收物質。
對低濃度樣本,優先選擇染料法。
樣品來源復雜,必須進行預處理以去除雜質。
高鹽或有機溶劑會顯著影響檢測結果,應進行稀釋或純化。
吸光度異常偏高
可能原因:比對液與樣本溶劑不一致。
避免方法:始終使用相同緩沖液作為空白。
結果重復性差
可能原因:樣品未混勻,取樣不均。
避免方法:檢測前充分混勻,避免產生氣泡。
A260/A280 比值偏離
可能原因:蛋白質或酚類污染。
避免方法:重復提取或進一步純化核酸。
無讀數或讀數過低
可能原因:樣本濃度過低或體積不足。
避免方法:提高樣本濃度或檢查移液準確性。
樣本記錄:所有檢測樣本需建立記錄,包括濃度、體積、保存條件。
分批檢測:對于大批量樣品,應統一條件,避免批間差異。
儀器清潔:檢測結束后用去離子水清洗檢測平臺,避免殘留污染。
人員培訓:操作人員必須熟悉 NanoDrop Eight 的基本原理和樣本要求。
賽默飛 NanoDrop Eight 分光光度計以其高通量、低樣本消耗和高精度的特點,已成為現代分子生物學和生物化學實驗室的重要工具。為了獲得可靠的實驗結果,必須嚴格遵循樣本體積、濃度、純度和緩沖液的要求,同時根據不同實驗場景調整樣本制備方法。通過掌握這些樣本要求,研究者不僅可以提升實驗效率,還能顯著提高數據的準確性和重復性。
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